Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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