Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Snx27Q3UHD6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx27Q3UHD6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Snx27Q3UHD6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx27Q3UHD6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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