Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll12Q3UDE2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms