Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cops9Q3U898 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cops9Q3U898 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cops9Q3U898 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cops9Q3U898 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cops9Q3U898 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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