Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp6Q3U6U5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms