Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q3U595 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q3U595 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Q3U595 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q3U595 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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