Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms