Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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