Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy4Q3TYX8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy4Q3TYX8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms