Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms