Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms