Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms