Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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