Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms