Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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