Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cd84Q18PI6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd84Q18PI6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms