Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms