Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms