Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms