Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata18Q0P557 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms