Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NeblQ0II04 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NeblQ0II04 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms