Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttc21bQ0HA38 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms