Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms