Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hoxc4Q08624 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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