Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms