Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms