Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Siah2Q06986 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms