Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms