Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms