Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms