Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms