Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff2Q03404 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms