Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms