Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms