Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms