Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms