Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms