Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms