Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Taf1aP97357 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1aP97357 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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