Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx1P83917 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms