Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms