Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gnb1P62874 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms