Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmc5P62196 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmc5P62196 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms