Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SnnP61807 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SnnP61807 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SnnP61807 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SnnP61807 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SnnP61807 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SnnP61807 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SnnP61807 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SnnP61807 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SnnP61807 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms