Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2kP61087 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2kP61087 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2kP61087 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2kP61087 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms