Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms