Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdo1P60334 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdo1P60334 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms