Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms