Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tubgcp3P58854 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tubgcp3P58854 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tubgcp3P58854 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tubgcp3P58854 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tubgcp3P58854 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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