Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P58686 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P58686 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P58686 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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